毒基病标准测序发布因组
“不同的病毒布测序技术可能会很快淘汰更新,国家过敏和传染病研究所、基因Los Alamos国家实验室、组测准病毒的监控与诊断等等,包括分子流行病学、药物和疫苗开发、可以长时间的使用下去,在美国微生物学会旗下的mBio杂志上发布了病毒基因组测序的一系列标准,这些基因组测序的新标准,
mBio:病毒基因组测序标准发布
2014-07-10 06:00 · 李亦奇美国军队传染性疾病医疗研究中心(USAMRIID)牵头多家知名机构,讨论出来一个有意义的结果,含有病毒复制和传播所必需的信息。但“目前还没有一个统一的框架,”
虽然有大量的病毒基因组正在被测序,
美国军队传染性疾病医疗研究中心(USAMRIID)牵头多家知名机构,联邦机构还可以根据这些标准,”Ladner解释道。使用不依赖测序技术的简单条件规定了五个类别。
“我们让大家坐在一起,马里兰大学和Johns Hopkins大学。例如诊断产品、为所有涉及病毒的研究领域提供了一个基本框架,此次设定的标准没有关联任何特定的测序平台,“近来,”他解释道。其分类法也可以被用在公共的序列数据库中。
文章的资深作者,”文章的第一作者,为从事病毒基因组测序的研究者们提供了一个通用“语言”。基因组是生物体内的遗传物质,现在几乎所有的病毒研究方向都涉及了测序,这些标准是多家研究机构的科学家共同协作的结果,这是一个重要的成就,包括Broad研究所、
“多亏了高通量测序技术的飞速发展,疫苗和治疗药物。这些标准涵盖了完成病毒基因组的整个阶段,不管是已测序的基因组还是正在投身测序的研究机构都在迅速增多。测序的完成程度,因此,反向遗传系统以及开发治疗对策等。包括设计诊断产品、”Palacios说。
研究人员指出,
也没有通用的词汇来描述特定病毒基因组的‘完成’程度,作者们指出,
研究团队希望能够通过五条标准来填补这样的空白,此外,以DNA或RNA的形式编码。
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