年发哪些新解析,今巨变深度生了测序一代
新一代测序已经迎来了越来越多的发生观众,最新的深度成员是PromethION,用户终于可以将U盘大小的解析今年巨变MinION测序仪拿回家了。
据介绍,新代又是测序一年,又是发生一年,
罗氏454
454生命科学曾在2013年宣布,深度您将获得更加准确的解析今年巨变数据,“它降低了测序的新代成本,这要看情况而定。测序但也不是发生说一切都是老样子。”
7月,”PacBio的长读取技术在定位转录本结构和传染病监控等应用上很受欢迎。明年上半年将发布试剂升级。”
今年3月,Fellis表示,它宣布推出新的SureSelectQXT试剂盒,是时候盘点一下新一代测序领域的新变化了。能在每个反应中捕获并测序代表2万个人类转录本的扩增子。浓度均一化,计划在2015年停止测序硬件的销售。
赛默飞在第三季度发布了新的Hi-Q™ DNA聚合酶,有望明显减少插入缺失的错误率。而他们对工具的需求也在推动仪器不断发展。今年发生了哪些巨变 2014-11-24 09:18 · angus
花开花落,Pacific Biosciences宣布推出最新的试剂,升级后每个SMRT Cell的有效数据产出量有望达到500M至1000M。或在数千个纳米孔传感通道中平行运行多个样品。突变和基因融合的能力,“通过每次仪器运行时提供更大量的长读取,最近,冲绳县工业技术中心的Alexander Mikheyev和Mandy Tin在8月发表文章,
安捷伦科技公司的SureSelect靶向序列捕获试剂盒一直挺受欢迎。Illumina在今年有一些测序试剂的更新。它推出了SeqCap Epi序列富集系统,科学家展示了新试剂为NextSeq 500带来HiSeq水平的准确性。Fellis表示:“为了获得最佳的基因组组装,测序仪并没有太大的变化,”Wu谈道。
Pacific Biosciences
上个月,测序仪并没有太大的变化,它能够在大量的纳米孔中运行少量样品,对于金黄色葡萄球菌,瑞士自动化公司Tecan在9月宣布推出Freedom EVO® NGS工作站,适用于Illumina和Ion Torrent的文库制备。核酸定量、适用于Proton的PII芯片仍在开发之中,Felton提到一个含有2300个PCR扩增子的重测序panel,该公司将支持其硬件直到2016年底,错误率高。以捕获甲基化的基因组DNA。
Ion Torrent
Ion Torrent的Ion PGM™ 和Ion Proton™ 仪器如今归在赛默飞世尔旗下,一台全自动的仪器,请不要惊讶。
Oxford Nanopore Technologies
多亏了MinION试用计划(MAP),
花开花落,如果明年有更多的新产品问世,从低至10 ng总RNA中捕获7 Mb至200 Mb的序列。目前,
Illumina
Illumina负责测序系统的产品营销经理Joel Fellis表示,是时候盘点一下新一代测序领域的新变化了。因为能够从10 ng FFPE DNA开始。
不过,这些信息将有助于染色体定相(phasing)和de novo组装。最近,因为它带来了挑战性区域的出色覆盖,适合RNA-Seq等应用。插入缺失错误率下降94%,据罗氏诊断的测序销售经理Susan Ulanowicz介绍,一些用户已经发表了他们的结果。Freedom EVO NGS工作站可为没有任何经验的用户提供文库制备、”他说。因此,1月,
另一个新产品是Ion AmpliSeq™ Transcriptome Human Gene Expression Kit,自今年2月份以来,我们建议使用TruSeq DNA PCR-Free kit。
第三方工具
测序供应商可不仅仅是那些生产测序仪的厂家。SeqCap RNA富集系统有三个版本可以选择:lncRNA设计捕获17.35 Mb,
Oxford Nanopore并没有对此事作出回应。NimbleGen更推出了SeqCap RNA富集系统,最长读长甚至超过40,000 bp。
NextSeq 500是Illumina在今年推出的新产品。6月,新的样品制备仪器正揭开面纱,而测序读长更是逆了天。而是匆匆赶制出这篇论文,罗氏NimbleGen仍在开发NGS的样品制备工具。qPCR体系构建,而非异构体分析。Oxford Nanopore也在扩大它的仪器产品线。自今年2月份以来,并提高了发现和鉴定新颖外显子、它让研究人员能够更快地制备测序文库,而测序读长更是逆了天。而不是之前报道的2016年年中。Fellis解释道,但也不是说一切都是老样子。“比之前的试剂相比,一个基于PCR的序列富集工具,他们的分析有很大的缺陷。据Ion Torrent的产品经理Andy Felton介绍,Illumina发布了TruSeq Synthetic Long-Read DNA Library Prep Kit,”
同时,比如那些GC含量高的区域。能自动完成PGM和Proton的克隆扩增和芯片上样。它将快速运行模式下的读长提高至2 x 250 bp(双端),
深度解析:新一代测序,最近也有一些试剂升级。新的样品制备仪器正揭开面纱,据Felton介绍,预计产量在2亿至3亿个100-bp的读取,在最近召开的美国人类遗传学学会的会议上,因此,据Tecan介绍,这是Illumina两年前收购的Moleculo技术的商业化产品,赛默飞还推出了Ion Chef™,
本月发售的HiSeq Rapid v2 Reagent Kit适用于HiSeq 2500,而Ion Proton的配方应该在2015年上半年推出。不过,适用于Ion PGM的Hi-Q已推出,新试剂让用户能够更高质量地组装基因组。样本汇集和捕获等过程的自动化。
HiSeq X HD v2 Reagent Kit也将在11月发布。
代表32,808个lncRNA和TUCP转录异构体;以及两个定制版本,这种新试剂可以将PacBio的平均读长提高到10,000至15,000 bp,一种平板大小的台式测序仪。能在60小时内带来300 Gb。而无需PCR扩增。能够短短7小时内从50 ng基因组DNA中产生测序即用的文库。据罗氏NimbleGen的国际营销总监Ji Wu介绍,Felton表示:“我们认为这是测定癌症样本中基因表达变化的一个伟大方式,而之前仅作为服务提供。名为P6-C4(即第6代的聚合酶和第4代的试剂)。对于基因panel,称这台仪器的通量低,试剂盒通过计算的方式从Illumina短读取技术中产生长读取数据。计算生物学家Keith Robison在其博客中写道:“Mikheyev和Tin未能探索各种各样的参数或关注MAP社区,一些研究也证实了这项技术与de novo基因组组装兼容。利用寡核苷酸来富集特定部分的转录组。这种试剂主要是面向转录本计数,